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完整版基因组2019年,加州大学圣克鲁兹分校的基因组学研究员Karen Miga和美国国家人类基因组研究所的Adam Phillippy成立了端粒到端粒(T2T)合作组,当时约有1/10的人类基因组仍然未知。如今,这个数字已经降到了零。在去年5月发布的一篇预印本论文中,T2T合作组公布了首个人类基因组的端到端序列,为大量使用的人类参考基因组序列GRCh38新增了近2亿个碱基对,并为人类基因组计划(Human Genome Project)补全了最后一章[1]。
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胎儿基因变异,刘蒙该如何抉择? 𐠥林大学第一医院生殖医学ⷤ遗传中心的检测报告显示,孕妇刘蒙的胎儿可能存在一些基因组变异。让我们一起来看看这些检测结果吧。 染色体微阵列(CMA)检测报告显示,胎儿的X染色体在xp11.4p11.23区域存在一个8.735Mb的缺失。这个区域涉及80个基因,其中一些是已知的单倍剂量敏感基因,与智力低下或视网膜变性有关。检测结果还提示,这个区域的缺失可能会导致疾病,因为DECIPHER数据库中有多例小片段的致病性及可能致病性案例。 另外,胎儿的11号染色体在11q2.1区域存在一个1.651Mb的重复。这个区域覆盖了OMIM基因CNTN5,但OMIM数据库没有收录该基因的表型关联记录。尽管如此,检测结果还是提示,这个区域的重复可能没有明确的临床意义。 报告还提到,这些检测结果是根据人类基因组GRCh38版本和DGV、DECIPHER、OMIM、CLinGen等公共数据库已公布数据确定的。对于小于500kb的缺失和小于1Mb的重复,检测结果通常不会报告,除非这些变异与明确的临床意义相关。 蠩要注意的是,这些检测技术并不能检测所有潜在的基因组不平衡,也不能检测芯片探针未覆盖的遗传区域异常。此外,羊水标本可能存在母血等母体细胞污染的风险,这可能会导致漏诊和误诊。 颀⚕️ 医生建议刘蒙进行遗传咨询,并定期进行超声检查。刘蒙夫妇可以在自愿的情况下进行CMA检测,以追踪胎儿异常片段的来源。 最后,检测结果仅对本次送检的标本负责,结果仅供临床参考。希望这些信息能帮助刘蒙和她的家人做出更明智的决定。
首次于2013年公布的GRCh38是一个很重要的研究工具,也是绘制测序序列的框架,但这个框架上还开着很多“天窗”。这主要是因为广泛使用的测序技术(由加州Illumina公司开发)虽然读长很准确,但太短,无法清晰绘制出高度重复的基因组序列,包括染色体末端的端粒以及在细胞分裂中协调新复制DNA分裂的着丝粒。
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